El Premio Andrés Núñez de Prado a la Investigación en Producción Ecológica, dotado con 6,000 euros, tiene como objetivo fomentar la investigación en este ámbito. La Asociación CAAE, junto a la familia Núñez de Prado, otorga anualmente este premio a la investigación más notable en esta materia. Según consta en las bases de la convocatoria, los trabajos que concurran en esta modalidad deben “considerar la producción ecológica como un sistema productivo cuyo principal objetivo es la obtención de alimentos de la máxima calidad de forma sostenible, protegiendo el medio ambiente, mediante el uso adecuado de recursos naturales y permitiendo a las personas del sector la realización de su trabajo en un medio más seguro”.